Thème 5: Récepteurs nucléaires dans la biologie circadienne
Présentation de la thématique de recherche
L'horloge biologique joue un rôle physiologique important. Par exemple, elle génère des rythmes circadiens dans le sommeil, la pression sanguine, la réponse immunitaire et le métabolisme. Une perturbation de l'horloge, par le travail posté, les décalages horaires fréquents ou l'exposition à la lumière la nuit, augmente le risque de développer des maladies métaboliques (obésité, diabète de type 2, NAFLD), inflammatoires et cardio-vasculaires (athérosclérose, infarctus du myocarde). En travaillant sur les composants de l'horloge et récepteurs nucléaires Rev-erbs et ROR, nous visons à comprendre les mécanismes cellulaires et moléculaires par lesquels l'horloge contrôle le métabolisme et l'inflammation dans plusieurs contextes physiopathologiques tels que le diabète, la NAFLD, l’athérosclérose et la régénération musculaire. Nous cherchons à déterminer si/comment la modulation pharmacologique de ces récepteurs nucléaires restaure la rythmicité circadienne et améliore ces conditions pathologiques. Notre équipe est engagée dans des collaborations avec les autres équipes de l'UMR1011, avec des équipes régionales, nationales et internationales pour compléter notre expertise et aller vers des études translationnelles.
Mots-clés
Rythmes circadiens ; métabolisme ; inflammation ; récepteurs nucléaires ; maladies métaboliques et cardiovasculaires
Dr Hélène DUEZ, PhD, HDR
Directrice de recherche 1, INSERM, responsable d’équipe
ORCID : 0000-0002-4130-7987
Je dirige l’équipe « Rythmes circadiens dans les maladies cardiométaboliques et inflammatoires » (UMR1011) à Lille. Au cours de ma thèse à l’Institut Pasteur de Lille (soutenue en 2003), j’ai identifié le rôle de récepteurs nucléaires dans le métabolisme des lipides et des acides biliaires, ainsi que dans le développement de l’athérosclérose. J’ai ensuite effectué un post-doctorat à l’Université de Toronto, où j’ai découvert que la production de lipoprotéines riches en triglycérides par l’intestin est augmentée chez les patients insulino-résistants. Mes recherches ont également porté sur le rôle des incrétines dans le métabolisme du glucose. Recrutée comme CRCN à l’Inserm en 2008, je dirige depuis une équipe dédiée à l’étude des mécanismes cellulaires et moléculaires par lesquels l’horloge biologique influence le métabolisme et l’inflammation dans divers contextes physio-pathologiques, notamment les maladies métaboliques, cardiovasculaires et musculaires.
J’ai reçu de nombreux financements compétitifs, notamment une bourse européenne MSCA ReIntegration Grant, des contrats de l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), du programme Équipe FRM, de l’European Foundation for the Study of Diabetes (EFSD), de la Fondation Francophone pour la Recherche sur le Diabète (FFRD), de la SFD et du programme CPER Équipe émergente. J’ai participé à plus 60 publications évaluées par les pairs dans des revues de haut niveau, telles que Nature Medicine, Gastroenterology, The Lancet, Nature Cardiovascular Research, Journal of Clinical Investigation, Circulation, ainsi que de plus de 70 conférences invitées.
Je siège dans plusieurs comités d’évaluation, dont le panel ERC Starting Grant LS4, les conseils scientifiques de la FFRD et de la FRM, ainsi que dans divers SAB et comités internationaux d’expertise.
Dr Benoit POURCET, PhD, HDR
Maître de conférence des Universités, Université de Lille
ORCID : 0000-0002-6758-5467
Benoit Pourcet, biochimiste de formation, est maitre de conférence des universités depuis 2016 à la faculté de pharmacie de l’université de Lille. Ses recherches portent principalement sur le rôle et la régulation des récepteurs nucléaires dans le contexte des maladies cardiométaboliques. Depuis 2004, au cours de son doctorat à l’Institut Pasteur de Lille et son post-doctorat à University College of London (Royaume-Uni), il a acquis de solides connaissances portant sur les mécanismes moléculaires impliqués dans le contrôle de l’activité transcriptionnelle des récepteurs nucléaires dans le contexte physiopathologique des maladies inflammatoires, métaboliques et cardiovasculaires. Il dirige maintenant un groupe de recherche s’intéressant à l’impact du récepteur nucléaire Rev-erb-α sur le développement de pathologies induite par des altérations de l’horloge circadienne comme l’athérosclérose, un domaine de recherche innovant complémentaire des projets développés dans l’équipe 5 et l’unité 1011.
Pr Yasmine SEBTI, PhD, HDR
Professeur des Universités, Université de Lille
yasmine.sebti[@]univ-lille.fr
Numéro ORCID : 0000-0002-1813-810X
Yasmine Sebti a été recrutée comme Maitre de conférences des universités en 2014 à la faculté de pharmacie de l’université de Lille avant d’être promue Professeur des Universités en Septembre 2025. Au cours de son doctorat, obtenu à l’Université de Rennes, et de son post doctorat effectué à Oxford University (Royaume-Uni), elle a acquis une solide expertise en Immunologie. Depuis 2009, elle a intégré l’UMR1011 où elle développe des projets portant sur le métabolisme et la physio-pathologie du muscle squelettique. Actuellement, elle dirige un groupe de recherche axé sur le rôle de l’horloge biologique, via l’étude des récepteurs nucléaires Rev-erbα et RORα, dans les processus inflammatoires au cours de la régénération musculaire, intégrant ainsi ses diverses expertises acquises tout au long de son parcours. Pour développer ses projets, elle a obtenu des financements compétitifs notamment des contrats de l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), de la SFD et de l’AFM-Téléthon.
Stéphane DELHAYE
Ingénieur d'étude, Univerqité de Lille
stephane.delhaye[@]univ-lille.fr
ORCID : 0000-0001-9438-6730
Stéphane Delhaye, a obtenu un diplôme de Master professionnel en 2005. A la fin de ses études il a d’abord intégré un laboratoire du Centre d’Infection et d’Immunologie de Lille avant d’arriver au sein de l’Unité INSERM UMR1011 en 2012 dans l’équipe du Dr. Hélène Duez. En 2017 il obtient un poste d’assistant ingénieur dans l’équipe, avant d’être promu ingénieur d’étude en 2026. Il travaille en particulier sur les modèles expérimentaux des différents projets de l’équipe.
Christian DUHEM
Ingénieur d’étude, Université de Lille
christian.duhempasteur-lille.fr
ORCID : 0000-0003-0931-3815
Sarah Ampen
Ingénieure d’étude, INSERM
sarah.ampen[@]pasteur-lille.fr
ORCID : 0009-0009-0284-1763
Sarah Ampen est ingénieure au sein de l’Unité 1011, sous la direction de Yasmine Sebti. Diplômée d’un Master en Omics and Systems Biology, elle développe des approches combinant biologie expérimentale et analyses bio-informatiques. Ses travaux portent sur le rôle des cellules lymphoïdes innées de type 2 (ILC2) dans l’homéostasie du muscle squelettique. Elle étudie leur signature moléculaire dans des contextes régénératifs et dégénératifs, notamment dans la dystrophie musculaire de Duchenne, à travers des analyses histologiques et des approches transcriptomiques (RNA-seq, single-cell RNA-seq), afin de mieux comprendre leur implication dans la régulation de la fibrose musculaire.
Lise FERRI
Post-Doctorante, INSERM
ORCID : 0000-0003-1981-4250
Lise Ferri est post-doctorante en physiologie. Elle s'intéresse à l'impact de l'altération du cycle biologique sur le développement de l'athérosclérose. Au cours de son doctorat, supervisé par le Dr Benoit Pourcet, son travail s’est concentré particulièrement sur le rôle du récepteur nucléaire Rev-erbα dans les mécanismes conduisant à l'instabilité de la plaque, y compris la calcification vasculaire et la néovascularisation intraplaque.
Margaux LEDUC
Etudiante en thèse, Université de Lille
ORCID : 0009-0009-7432-9574
Margaux Leduc est doctorante sous la direction du Pr. Yasmine Sebti et du Dr. Hélène Duez. Elle a intégré l’équipe 5 de l’U1011 lors de son stage de Master 2 - Management de l’expérimentation préclinique. Ses travaux de thèse portent sur l’évaluation du rôle de l’horloge biologique dans les processus inflammatoires au cours de la régénération musculaire.
Salomé Farge
Etudiante en thèse, Université de Lille
ORCID : 0009-0002-6366-3197
Après son diplôme d’ingénieur, Salomé Farge a rejoint l’équipe 5 de l’U1001 pour réaliser son doctorat sous la direction du Dr Benoit Pourcet. Son travail se concentre principalement sur le rôle du récepteur nucléaire Rev-erb-α dans les mécanismes conduisant à l'instabilité de la plaque, en particulier la néovascularisation intraplaque via la perturbation du flux sanguin.
Emma Rassart
Stagiaire Erasmus Master 2, Université de Mons, Belgique
Travaux récents de l'équipe :
Nous avons montré que la signalisation de l’insuline est nécessaire à l’organisation circadienne du métabolisme hépatique (Fougeray et al. Cell Rep 2022) et le rôle de l’horloge des macrophages dans le développement de la MASLD chez la souris obèse insulino-résistante (Hebras et al., in revision)
Nous avons montré que la réponse à une infection à pneumocoque varie en fonction du moment de l’infection, et que cette réponse diurne est altérée chez la souris âgée. La modulation pharmacologique de Rev-erbα chez la souris âgée permet d’améliorer la résistance à l’infection de ces souris (Silva Angulo et al., Cell Reports 2025)
Nous avons montré que Rev-erbα joue un rôle central dans la physiologie musculaire en contrôlant la biogenèse et la fonction mitochondriales (Woldt, Sebti et al., Nature Medicine 2013) et les flux calciques (Boulinguiez, Duhem et al., JCI Insight 2022).
Nous avons découvert que la susceptibilité au développement de pathologies inflammatoires aigües varie au cours de la journée et que Rev-erb-α est un acteur majeur de l’immunité circadienne en contrôlant l'inflammasome NLRP3 (Pourcet et al., Gastroenterology, 2018)
Dans un travail collaboratif, nous avons montré l’impact de la chronobiologie sur l’incidence des pathologies cardiaques post-opératoires (Montaigne et al. The LANCET, 2018)
L'équipe 5 de l'UMR1011 a développé différentes expertises :
- Nous avons développé une macro Fiji appelée MUSCLE J qui nous permet de quantifier la surface des fibres musculaires, le nombre et la localisation des noyaux, cellules souches musculaires et cellules endothéliales entre autres (Mayeuf-Louchart et al. Skeletal Muscle, 2018)
- Nous avons développé des modèles d'altération génétique ou environnementale de l'horloge circadienne afin de mieux comprendre le rôle des différents acteurs du rythme circadien dans le développement des maladies métaboliques, inflammatoires et cardiovasculaires.
- Nous avons mis en place la transparisation d’organes, associé à de la microscopie à feuille de lumière et la reconstruction des images en 3D afin d’obtenir une représentation des tissus
-Nous possédons également une expertise dans les domaines suivants : chronobiologie/chronopharmacologie, phénotypage métabolique, étude de la respiration mitochondriale par oxygraphie (Oroboros, Seahorse) et du flux calcique, immunophénotypage (FACS/immunohistochimie), imagerie (microscopie confocale, à feuille de lumière, imagerie d'organes entiers), RNAscope, culture cellulaire (lignées, cellules primaires).
Liste des publications majeures de l'équipe 5 :
Woldt E. *, Sebti Y. *, Solt L.A., Duhem C., Lancel S., Eeckhoute J., Hesselink M.K.C., Paquet C., Delhaye S., Shin Y., Kamenecka T.M., Schaart G., Lefebvre P., Nevière R., Burris T.P., Schrauwen P., Staels B., Duez H. Rev-erb-α modulates skeletal muscle oxidative capacity by regulating mitochondrial biogenesis and autophagy. Nature Medicine, 2013, 19(8) : 1039-1046.
Montaigne David, Maréchal Xavier, Modine Thomas, Coisne Augustin, Mouton Stéphanie, Fayad Georges, Ninni Sandro, Klein Cédric, Ortmans Staniel, Seunes Claire, Potelle Charlotte, Berthier Alexandre, Gheeraert Celine, Piveteau Catherine, Deprez Rebecca, Eeckhoute Jérome, Duez Hélène, Lacroix Dominique, Deprez Benoit, Jegou Bruno, Koussa Mohamed, Edme Jean-Louis, Lefebvre Philippe, Staels Bart. Day-time variation of peri-operative myocardial injury in cardiac surgery and its prevention by Rev-erbɑ antagonism: a single-centre propensity-matched cohort study and a randomised study. The LANCET, 2018, 391:59-62
Lancel S, Hesselink MK, Woldt E, Rouillé Y, Dorchies E, Delhaye S, Duhem C, Thorel Q, Mayeuf-Louchart A, Pourcet B, Montel V, Schaart G, Breton N, Picquet F, Briand O, Salles JP, Duez H, Schrauwen P, Bastide B, Bailleul B, Staels B, Sebti Y. Endospanin-2 enhances skeletal muscle energy metabolism and running endurance capacity. JCI Insight, 2018, 3(9). pii: 98081. doi: 10.1172/jci.insight.98081
Pourcet B*, Zecchin M*, Ferri L, Beauchamp J, Sitaula S, Billon C, Delhaye S, Vanhoutte J, Mayeuf-Louchart A, Thorel Q, Haas J, Eeckhoute J, Dombrowicz D, Duhem C, Boulinguiez A, Lancel S, Sebti Y, Burris T, Staels B and Duez H. Nuclear Receptor Subfamily 1 Group D Member 1 (Rev-erb-α) Regulates Circadian Activity Of NLRP3 Inflammasome to Reduce the Severity of Fulminant Hepatitis in Mice. Gastroenterology, 2018, 154(5):1449-1464.e20
Mayeuf-Louchart A, Lancel S, Sebti Y, Pourcet B, Loyens A, Delhaye S, Duhem C, Beauchamp J, Ferri L, Thorel Q, Boulinguiez A, Zecchin M, Dubois-Chevalier J, Eeckhoute J, Vaughn LT, Roach PJ, Dani C, Pederson BA, Vincent SD, Staels B, Duez H. Glycogen Dynamics Drives Lipid Droplet Biogenesis during Brown Adipocyte Differentiation. Cell Rep. 2019, 29(6):1410-1418.e6. doi: 10.1016/j.celrep.2019.09.073. PMID: 31693883
Boulinguiez A*, Duhem C*, Mayeuf-Louchart A, Pourcet B, Sebti Y, Kondratska K, Montel V, Delhaye S, Thorel Q, Beauchamp J, Hebras H, Gimenez M, Couvelaere M, Zecchin M, Ferri L, Prevarskaya N, Forand A, Gentil C, Ohana J, Piétri-Rouxel F, Bastide B, Staels B, Duez H*, Lancel S*. Nuclear Receptor Subfamily 1 Group D Member 1 controls skeletal muscle calcium homeostasis through myoregulin repression. JCI Insight 2022 Sep 8;7(17):e153584. doi: 10.1172/jci.insight.153584.
Fougeray T, Polizzi A, Régnier M, Fougerat A, Ellero-Simatos S, Lippi Y, Smati S, Lasserre F, Tramunt B, Huillet M, Dopavogui L, Salvi J, Nédélec E, Gigot V, Smith L, Naylies C, Sommer C, Haas JT, Wahli W, Duez H, Gourdy P, Gamet-Payrastre L, Benani A, Burnol AF, Loiseau N, Postic C, Montagner A*, Guillou H*. The hepatocyte insulin receptor is required to program the liver clock rhythmic gene expression Cell Reports 2022, 39
Manjula Vinod, Alexandre Berthier, Xavier Maréchal, Céline Gheeraert, Raphaël Boutry, Stéphane Delhaye, Jean-Sébastien Annicotte, Hélène Duez, Agnès Hovasse, Sarah Cianférani, David Montaigne, Jérôme Eeckhoute, Bart Staels, Philippe Lefebvre. Timed use of digoxin prevents heart ischemia-reperfusion injury through a REV-ERBα-UPS signaling pathway. Nature Cardiovascular Research, 2022, 1, 990-1005.
J. Yang, H.D. de Vries, A. Mayeuf-Louchart, J.H. Stroeve, V.W. Bloks, M. Koehorst, H. Duez, B. Staels, F. Kuipers, T. van Zutphen. Role of bile acid receptor FXR in development and function of brown adipose tissue. Biochim Biophys Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids. 2023;1868(2):159257.
Anne Danckaert*, Aurélie Trignol, Guillaume Le Loher, Sébastien Loubens, Bart Staels, Hélène Duez, Spencer L. Shorte, Alicia Mayeuf-Louchart*. MuscleJ2: a rebuilding of MuscleJ with new features for high‑content analysis of skeletal muscle immunofluorescence slides. Skeletal Muscle 2023;13(1):14
F. Silva Angulo, C. V. Joseph, L. Delval, L. Deruyter, S. Heumel, M. Bicharel, P. Brito Rodrigues, V. Sencio, T. Bourguignon, M. Gomes Machado, M. Fourcot, S. Delhaye, S. Salomé-Desnoulez, P. Valet, S. Adnot, I. Wolowczuk, J. C. Sirard, M. Pichavant, B. Staels, J. T. Haas, R. Gref, J. Vandel, A. Machelart, H. Duez$, B. Pourcet*$, and F. Trottein*$. Rev-erb-α antagonism in alveolar macrophages protects against pneumococcal infection in elderly mice. Cell Reports 2025, Volume 44, Issue 2, 115273
Liste des principaux financeurs de l'équipe 5 :
Fondation pour la Recherche Médicale (FRM), Agence Nationale pour la Recherche (ANR), ANR-Labex-EGID, AFM-téléthon, Fondation de France, Société Française du Diabète, Fédération Française de Cardiologie, Institut Pasteur de Lille ; Université de Lille ; Inserm
Dr Duez Hélène
Directrice de Recherche, INSERM
INSERM U1011 – Institut Pasteur de Lille-Université Lille Nord de France – EGID
1 rue Calmette, BP245, 59019 Lille
Tel: +33(0)3.2087.7793
Email : helene.duezpasteur-lille.fr ; helene.duezinserm.fr
Liste des anciens membres de l'équipe 5 :
Marie Bicharel Leconte : Ingénieure d'étude
Aurore Hebras : Etudiante en thèse / Post doctorante
Cecilia Bellengier : Etudiante en thèse